• 1.数据存储的方式不同，MyISAM 中的数据和索引是分开存储的，而 InnoDB 是把索引和数据存储在同一个文件里面。
• 2.对于事务的支持不同，MyISAM 不支持事务，而 InnoDB 支持 ACID 特性的事务处理
• 3.对于锁的支持不同，MyISAM 只支持表锁，而 InnoDB 可以根据不同的情况，支持行锁，表锁，间隙锁，临键锁
• 4.MyISAM 不支持外键，InnoDB 支持外键

当然也可以从索引结构、存储限制等方面，更加深入的回答。

具体参考如下官方文档：https://dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/innodb-introduction.htm